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臨床FFPE核酸提取試劑盒的操作中哪些更有利于正確結(jié)果

發(fā)布日期: 2019-03-18
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臨床FFPE核酸提取試劑盒為從經(jīng)福爾馬林固定石蠟包埋組織(簡(jiǎn)稱FFPE)中提取DNA提供一種高質(zhì)量、快速、的方法。本試劑盒采用可以特異性結(jié)合DNA的離心吸附柱和*的緩沖液系統(tǒng)。可大限度去除雜質(zhì)蛋白及細(xì)胞中其他有機(jī)化合物。使用本試劑盒提取DNA無(wú)需用二甲苯去蠟,操作簡(jiǎn)單、安全。提取所得的DNA可直接應(yīng)用于PCR等下游實(shí)驗(yàn)。
1.將石蠟樣品切成5-10μm厚的切片。注意:若石蠟塊保存于室溫,則棄去起始的2~3片切片。切片厚度以5μm為佳,適當(dāng)去除無(wú)組織的蠟質(zhì)可提高提取效率。
2.將4-8片切片置于1.5-mL離心管中(自備),加入300μL除蠟液DB。
3.將離心管置于80℃孵育30min,期間10min后取出短暫渦旋混勻。
4.于室溫冷卻2-3min,加入10μL的蛋白酶K,渦旋混勻,55℃孵育30-60min至無(wú)明顯組織塊。(視組織量的多少,可酌情減少或增加孵育時(shí)間。)
5.13,000rpm離心1min。用槍頭小心刺穿液面表層蠟?zāi)ぃ∠聦忧逡褐列碌?.5-mL離心管中(自備)。
注意:切勿吸到上層渾濁蠟層,否則石蠟可能對(duì)DNA純度有影響。
6.加入400μL裂解液LB,顛倒混勻,室溫靜置10min。
7.加入800μL無(wú)水乙醇,渦旋10sec。
8.將吸附柱置于2-mL收集管中,再將上述液體轉(zhuǎn)移至吸附柱中,每次加入750μL,13,000rpm離心1min,棄收集管中的濾液。
9.重復(fù)步驟8,直至將所有溶液都經(jīng)過(guò)吸附柱過(guò)濾,棄濾液。
10.向吸附柱中加入已用無(wú)水乙醇配制的洗滌液WB1500μL,13,000rpm離心1min,棄廢液。
11.將吸附柱重新放回2-mL收集管中,加入600μL洗滌液WB2,13,000rpm離心1min,棄廢液。
12.重復(fù)步驟11兩次。
13.將吸附柱重新放回2-mL收集管中,于室溫13,000rpm空柱離心1min后,置于新的1.5-mL無(wú)核酸酶污染的離心管中。開(kāi)蓋室溫靜置或超凈工作臺(tái)風(fēng)干5min,以*揮發(fā)殘余的乙醇。
注意:殘留的乙醇可能會(huì)影響后續(xù)的PCR等實(shí)驗(yàn)。
14.向吸附柱柱膜中央上方小心加入35-100μL無(wú)核酸酶污染的純水(此步驟請(qǐng)謹(jǐn)慎操作,槍頭請(qǐng)勿接觸柱膜,純水經(jīng)65℃溫浴后再加入有助于提高洗脫效率),室溫靜置3-5min,13,000rpm離心1min,洗脫液即為DNA溶液。(建議:為提高DNA濃度,可將洗脫液重新加回柱膜中央,靜置3min后,以13,000rpm離心1min洗脫DNA。)
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