shRNA表達(dá)克隆是將針對靶基因設(shè)計shRNA(小發(fā)夾結(jié)構(gòu)RNAi)靶點序列,然后將其裝于表達(dá)載體中,我公司現(xiàn)可提供4套表達(dá)載體,可用于對人、小鼠、大鼠以及其他物種的全基因組范圍的基因表達(dá)抑制研究。公司還提供相應(yīng)的全長人類和小鼠基因的ORF表達(dá)克隆,可用于相應(yīng)基因的功能獲得研究,還可用于shRNA克隆的確證。
shRNA表達(dá)克隆的特性
1.所有shRNA靶點序列的選取均經(jīng)過準(zhǔn)確算法計算。根據(jù)基因的不同,shRNA其莖的長度在19到29堿基對之間。這些保證shRNA克隆表達(dá)后有很高的表達(dá)抑制效率和zui低的脫靶效應(yīng)(offtargeteffect)。
2.克隆shRNA所采用的載體有慢病毒載體和以哺乳動物細(xì)胞為宿主的載體,各類載體擁有不同的啟動子和跟蹤標(biāo)記基因可供選擇。
3.載體中所帶有的綠色熒光跟蹤標(biāo)記基因(eGFP)可以用于監(jiān)測質(zhì)粒載體的轉(zhuǎn)染效率和轉(zhuǎn)導(dǎo)病毒的感染效率。
4.載體結(jié)構(gòu)上帶有穩(wěn)定細(xì)胞株的篩選標(biāo)記(嘌呤霉素)和綠色熒光跟蹤標(biāo)記基因(EGFP),這些特性使得該載體既能用于穩(wěn)定抑制效應(yīng)的研究,也
5.可用于瞬時抑制效應(yīng)的研究。
6.使用慢病毒載體系統(tǒng),可轉(zhuǎn)導(dǎo)shRNA進(jìn)入常規(guī)的分裂細(xì)胞,以及不分裂而難以轉(zhuǎn)染的目的細(xì)胞株。
7.載體的各部分序列已經(jīng)過測序,包括啟動子、編碼shRNA的正義和反義鏈、發(fā)夾結(jié)構(gòu)、終止子和其他接頭序列。