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初步了解什么是非靶向代謝組

發(fā)布日期: 2022-01-21
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   非靶向代謝組學(xué)是通過比較對照組和實驗組的代謝組,以尋找其代謝譜差異的一種研究方法。這些差異可能與臨床生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)中研究的某些疾病相關(guān),也可能與藥物研發(fā)毒理研究中候選藥物攝入后的代謝改變有關(guān)。同時進(jìn)行化學(xué)結(jié)構(gòu)的鑒定,進(jìn)一步解釋差異代謝物及其參與的代謝通路與相關(guān)生物學(xué)過程的關(guān)系。
  
  代謝組學(xué)是指細(xì)胞、組織、器官或者生物體內(nèi)的所有小分子代謝組分(主要是相對分子量1000以內(nèi)的內(nèi)源性小分子)的集合。代謝組學(xué)分為靶向代謝組學(xué)和非靶向代謝組學(xué)。
  
  新陳代謝網(wǎng)絡(luò)是十分復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò),而人體的代謝網(wǎng)絡(luò)尤為復(fù)雜?,F(xiàn)在多數(shù)信號通路的研究都是集中在代謝網(wǎng)絡(luò)的一個很小的領(lǐng)域。基因組學(xué)、蛋白組學(xué)研究雖然已經(jīng)揭示了部分調(diào)節(jié)通路,但是和代謝網(wǎng)絡(luò)直接相關(guān)的是代謝產(chǎn)物。從茫茫多的代謝產(chǎn)物中選取研究對象,無疑是大海撈針。非靶向性代謝組學(xué)又稱為發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué),主要是將對照組和實驗組的代謝組(某一生物體的全部代謝物)進(jìn)行比對,以找出其代謝物的差異。
  
  非靶向代謝組學(xué)流程中,第一步對樣品進(jìn)行前處理,提取代謝物;之后使用MS或者NMR對這些代謝物進(jìn)行檢測獲取原始數(shù)據(jù);原始數(shù)據(jù)經(jīng)過數(shù)據(jù)處理之后轉(zhuǎn)換成可供下一步數(shù)據(jù)分析的數(shù)據(jù)矩陣,通常在這個數(shù)據(jù)集中行數(shù)對應(yīng)樣本的個數(shù),列數(shù)對應(yīng)變量(代謝物信號)的個數(shù)。接著,對數(shù)據(jù)集進(jìn)行數(shù)據(jù)分析包括數(shù)據(jù)前處理和具體的分析,最終獲得代謝標(biāo)記物。
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